Wednesday, October 24, 2012

Biochemistry-links sites

Access Excellence Graphic Gallery — Extensive links

Acid-Base Equilibria
 — Extensive information, calculations 

Anabolic & Catabolic Pathway I — Information

Antioxidants and Free Radicals II
 — Information

Antioxidants and Free Radicals III
 — Information, diagram 

Biochemical Gallery — Links, information

Biochemistry I
 — Information, structural diagrams 

Biochemistry II — Extensive hyperlinks to many topics 

Biochemistry Links I — Information, diagrams

Biochemistry Links II
 — Extensive

Biochemistry Links III
 — Extensive

Biochemistry Links: Animations, Movies Interactive Tutorials
 — Extensive 

Biochemistry & Molecular Biology Links 

Biochemistry Page: Medical — Links

Biochemistry: Problem Sets and Tutorials

Biochemical Reactions. Enzyme Catalysis
 — Links. information, graphs

Biochemical Tests, Techniques
 — Links, information, diagrams 

Biochemistry: Tutorial & Animation Links 

Bioenergetics — Information, labeled photomicrograph

Biological Molecules 
— 4 links

Biological Molecules: Test Reagents
 — Information, illustrations 

Biology Lessons for Teachers: Cell Chemistry — Links 

Botany Online: Hypertextbook — Extensive links. 

Carbohydrates, Lipids & Proteins — Information, links Info, links 

Carbon: Molecular Diversity of Life — Links 

Catabolic Pathways: Alternate — Notes

Cell Chemistry: pH & Buffers
 — Information, graphs, equations

Cells: Basic Metabolism I 
— Links, information

Cells: Basic Metabolism II
 — Information, diagram, links

Cell Chemistry Links: Animations, Movies Interactive Tutorials — Extensive

Cellular Metabolism: Humans — Extensive information, illustrations

Chemical Basis of Life: Silicon vs. Carbon I — Notes

Chemical Basis of Life: Silicon vs. Carbon II — Discussion 

Cellular Metabolism & Fermentation — Information, illustrations, links

Chemical Energetics I — Information, links

Chemical Energetics & Enzymes — Information, chart 

Chemical Finder — Site search. Links

Chemical Reactions — Information, diagrams 

Chemistry Basics for Biology Students — Book Purchase. George I. Sackheim (7th ed) 

Chemistry Tutorial for Biology Students 

Chemistry Lessons & Tutorial Materials — Information, reactions

Dehydration Synthesis & Hydrolysis — Information 

Energy — General information 

Food Test: Protein — Biuret test

Food Tests: Lipids, Proteins — Lab. Very basic

Free Radicals and Antioxidants I — Information

Free Radicals and Antioxidants II — Information, diagrams

Glucose Metabolic Pathways — Information, charts

Graphics Gallery: Cell Chemistry — Links 

Hydrolysis Reactions — Information

Ionic Equilibrium — Links, notes, diagram

Ions and Small Molecules — Information, links, illustrations

Large Molecule Problem Set — Information, links

Light (Photon) Absorption — Information, diagrams, graphs, links

Macromolecules I — Information, links

Macromolecules II — Extensive links

Macromolecules III — Information, links

Macromolecules: Image Library — Links

Medical Biochemistry Pages — Links

Metabolic Pathways I — Links

Metabolic Pathways II — Molecular pathways illustrated

Metabolic Poisons: Mitochondria — Information

Metabolism — Links, notes, diagrams

Metabolism: Intermediary — Links, notes, illustration

Metabolism Overview I — Information, diagrams 

Metabolism Overview II — Information, diagrams 

Metabolism Problem Set — Links

Metabolism: Thermodynamics I — Extensive information, graphs

Metabolism:Thermodynamics II — Information, diagrams

Minerals: Nutrients and Toxins — Links, questions/answers 

Molecular Biology: Beginner's Guide — Links, notes 

Molecular Biology and Biochemistry Links — Extensive

Molecular Biology of Cells — Information

Molecular Biology Links — Annotated links biology

Molecular Biology Resources I — Links

Molecular Biology Resources II — Links

Molecular Biology: Techniques — Links 

Organic Biochemistry — Information, diagrams, table 101 Lectures/Biochemistry/biochemi.htm 

Organic & Biochemistry I — Information, links 

Organic & Biochemistry II — Information, links 

Organic Molecules— Extensive information, illustrations 101 Lectures/Biochemistry/biochemi.htm 

Oxidation Reduction Reactions — Information 

pH Indicators — Information, table

Photosynthesis, Energy and Life — Information, links

Phytochemicals — Information, tables

Reactions and Enzymes — Links, graphs, illustrations, notes

RasMol Home Page — Information, links

Radiation: Effect on Cells I — Extensive information 

Radiation: Effect on Cells II — Information, table 

Silicon Based Life Forms? I — Information, illustration, links

Silicon Based Life Forms? II — Extensive information, illustration, links

Silicon Based Life Forms? III — Information

Small Molecules and Ions — Links, information

Thermodynamics I — Links, notes, equations

Thermodynamics II — Links, notes ext info, equationsVitamins — Links, information, table

Water and Organic Molecules — Links, notes, diagrams

Water Properties I — Information, illustrations 

Water Properties II — Information, illustrations, quiz 

Water Properties III — Information 

Water Properties IV — Illustrations, information 

Water Properties: Physical — Information, illustrations, chart 

[SIZE=+1]Macromolecules, structure, function:[/SIZE] 
[SIZE=+1]Carbohydrates[/SIZE]Benedict's Test for Reducing Sugars — Notes, diagrams 

Carbohydrates I — Information, illustrations, links 

Carbohydrates II — Extensive information, illustrations 

Carbohydrates III — Links, notes, diagramn, photomicrographs

Carbohydrates IV 
— Links 

Carbohydrates V 
— Links, notes, diagrams 

Carbohydrates: General References 
— Information, links 

Carbohydrate metabolism 
— Links, notes, diagrams, tables

Carbohydrate Metabolism Regulation Problem Set 
— Linked problem sets 

Carbohydrates I — Information, animation, diagrams 

Carbohydrates II 
— Information, diagrams OrgChem/SASCarbo.htm 

Carbohydrate Sources — 
Information, links 

Carbohydrate Turnover — Notes, diagrams 

Cellulose and Chitin — Diagrams, notes 

Dietary Fiber — Information, tables 

 — Links, diagrams 

Disaccharides & Polysaccharides 
— Information, diagrams 

Glycogenesis — Information, links 

Glycogen Metabolism — Links, extensive information,

Glucose: General References 
— Information, diagrams 

Glucose Polymerization 
— Links, notes, molecular diagrams 

Heteropolysaccharides: Glycosaminoglycans and Proteoglycans 
— Links, information, diagrams, tables 

 — Information, diagrams 

Monosaccharides, Disaccharides & Polysaccharides 
— Extensive notes, diagrams 

Oligosaccharides — Defines, information, theraputic effects, sources, links 

Oligosaccharides and Flatulence — Information 

— Information 

— Brief notes, diagrams

Pentose Phosphate Pathway 
— Links, pathways, information, diagram 

Pentose Phosphate Pathway and Lipid Metabolism — Information, pathways 

— Links, information 

Starch Digestion by Amylase — Lab. Links, information

Starch Test: IKI 
— Brief procedure 

Essential Fats — Links, information, charts 

Fat Substitutes — Information

Fatty Acid Metabolism 
— Tutorial 

Fatty Acid Oxidation — Links, information, diagrams 

Fatty Acid Oxidation and Keytone Bodies — Links, information, diagrams 

Fatty Acids I — Links, information, tables, diagrams 

Fatty Acids II — Links, information, examples, diagrams 

Fatty Acid Synthesis — Information 

Food Tests: Lipids, Proteins — Lab exercise. Information 

Ketone Bodies — Information 

Lipid Biosynthesis — Information, Illustrations, tables, diagrams 

Lipid Catabolism — Extensive information, illustrations 

Lipid Digestion and Lipoproteins — Links, tables, information 

Lipid Descriptions — Information, links 

Lipid Metabolism I — Links, molecular diagrams, pathways, information 

Lipid Metabolism II — Links, information, pathway 

Lipids I — Information, illustrations, links, chart 

Lipids II — Information, illustrations 

Lipids III — Information, illustrations, links 

Lipids and Related Compounds — Described, illustrated, links 

Lipid Structure and Function — Links, information, table, diagrams 

Lipoproteins and Lipid Digestion — Links, information, tables 

Macromolecules I — Links, extensive information 

Macromolecules II — Extensive links 

Macromolecules III — Problem set. Links 

Macromolecules IV — Information, links 

Phospholipids I — Information, illustrations, links 

Phospholipids II — Information, illustrations 

Steroid Hormones I — Information, synthesis, chart, links 

Steroid Hormones II — Links, information, illustrations, pathways 

Triglycerides I — Information, illustrations, chart 

Triglycerides II — Defined, information, links 

Waxes — Information, table, illustration 

Alpha Helix Geometry — Information, illustrations 

Amino Acids I — Information, illustrations, chart, links 

Amino Acids II — Information, diagram, tables

Amino Acids III — Links, overview, references 

Amino Acids: Biochemistry — Links, information, table, graph, illustration 

Amino Acid Biosynthesis — Information, illustrations, reactions, links 

Amino Acid Chemistry — Info, illustrations 

Amino acids: Chromatography I — Information, diagrams 

Amino acids: Chromatography II — Lab with lessons

Amino Acid Derivatives 
— Neurotransmitters, etc. 

Amino Acid Metabolism I — Extensive: 22 hyperlinks 

Amino Acid Metabolism II — Extensive links, information 

Amino Acid Metabolism III — Info, illustrations 

Amino Acid Metabolism and Protein Turnover — Information 

Amino Acids: Essential, Nonessential — Information, diagram, links 

Amino Acid Synthesis I — Pathways, information, diagrams

Amino Acid Synthesis II — Information, tables, pathways

Bonding and Protein Structure — Information, references

Cysteine — Diagram, notes

Disulfide Bond I — Information, diagram, links

Disulfide Bond II — Diagram, brief note 

Disulfide Bonds & Permanent Waves — Information, illustrations 

Food Tests: Lipids, Proteins — Lab. Elementary

Hemoglobin Allostery I — Information

Hemoglobin Allostery II — Notes, diagram, graph

Hemoglobin Structure — Information, references

Insulin Synthesis — Information, diagram, graph Synthesis and Secretion

Nitrogen Metabolism and the Urea Cycle — Links, pathways, tables

One Gene, One Enzyme, One Reaction — Information 

Peptide Bond — Information, illustration 

Peptide Bonds I — Brief information, illustration, chart 

Peptide Bonds II — Information, illustration 

Peptide Bonds III — Information, illustrations 

Peptide Bonds IV — Reaction, information, illustrations 

Peptides I — Notes, illustrations 

Peptides II — Information, classes, links 

Peptides and Proteins I — Links, extensive information, charts 

Peptides and Proteins II — Information, illustrations 

Polypeptides — Information, illustrations 

Proline: Unusual Bond Angle — Information, diagrams 

Protein Folding I — Extensive illustrations, information

Protein Folding II — Information, links

Protein Metabolism — Links, notes, reactions, chart

Protein Purification — Extensive information

Protein Structure I — Topical links, diagrams,information 

Protein Structure II — Links, notes, diagrams

Protein Structure III — Information, diagram, links 

Protein Structure IV — Extensive information, illustrations, charts 

Protein Structure: Primary — Diagram, notes, links

Protein Structure: Quartenary — Illustrations,

Protein Structure: Secondary — Definition, links 

Proteins & Polypeptides— Very extensive information, illustrations 

Proteins: Primary through Quartenary Structure I — Information, links 

Proteins: Primary through Quartenary Structure II — Informational links 

Protein Structure: Tertiary — Information, diagrams, links

Protein Synthesis I — Diagram notes

Protein Synthesis II — Links, information, codon chart, t-RNA illustration

Protein Test: Biuret Reagent I — Brief & elementary

Protein Test: Biuret Reagent II — Very brief procedure, summary

Tyrosine I — Information, diagrams, chart 

Tyrosine II — Information, illustration 

Activation Energy and Catalysis 

Catalase I — Links, information 

Catalase II — Information, references

Catalase III — Information, illustrations, links 

Catalase Kinetics — Information, diagrams, graphs 

Catalase: pH Effects — Notes, graph, table 

Catalase Structure and Active Site — Information 

Catalysis — Information, graph 

Coenzymes I — Definition coenzyme 

Coenzymes II — Information, illustration 

Coenzymes, Cofactors I — Information

Coenzymes, Cofactors II — Information, table 

Coenzymes, Cofactors III — Information, links 

Competitive, Noncompetitive Inhibition I — Information 

Competitive, Noncompetitive Inhibition II — Infprmation, graphs 

Competitive Inhibition: Rubisco — Information, illustrations 

Enzyme 3D-Structure — Information, illustration, links 

Enzyme Activation Energy - Brief introduction 

Enzymes: Allosteric I — Information, diagrams, graphs 

Enzymes: Allosteric II - Information, graph 

Enzymes: Allosteric III — Information, diagrams, graphs 

Enzymes: Allosteric IV — Information 

Enzyme Cofactors, Activators, Prosthetic Groups — Information 

Enzyme Concentration: Effects — Information, graphs, table 

Enzymes, Energy and Catalysis — Problem Set. Information, links 

Enzyme Etymology and history — Information 

Enzyme Function — Information, related links 

Enzyme Inhibitation I — Information, illustrations

Enzyme Inhibition II — Information, illustrations, graphs , equations

Enzyme Inhibition III — Diagram, information 

Enzyme Inhibition IV — Information, pathways 

Enzyme Investigations
 — Lab, Information, links 

Enzyme Kinetics I — Information, diagrams, graphs, tables, links 

Enzyme Kinetics II — Information, illustrations, tables 

Enzyme Kinetics III — Links, information, tables, graphs equations 

Enzyme Kinetics IV — Pages of information, illustrations, equations 

Enzyme Kinetics: Michaelis-Menten I — Information, graphs, equations

Enzyme Kinetics: Michaelis-Menten II — Information, equations 

Enzyme Kinetics: Michaelis-Menton Constant — Information, graphs 

Enzyme Kinetics: Michaelis-Menten Equation — Lineweaver-Burk Plot 

Enzyme Lab: Temperature, pH Effects I — Information, illustrations, graphs 

Enzyme Lab: Temperature, pH Effects II — Information illustration 

Enzyme Mechanisms I — Extensive information 

Enzyme Mechanisms II — Notes, reactions 

Enzyme Mechanisms Affecting Structural Properties — Linked examples 

Enzyme Reaction rates: 4 Factors — Links 

Enzyme Regulatory Modification — Information 

Enzymes I — Defined, links, illustration 

Enzymes II — Animation with links 

Enzymes III — Extensive information, illustrations, graphs 

Enzymes: Factors Affecting I — Links, notes, graphs, illustrations 

Enzymes: Factors Affecting II — Notes, graphs 

Enzymes: pH Effects I — Notes, graphs, illustrations

Enzymes: pH Effects II— Notes, graph, table 

Enzymes: Reaction Types — Nomenclature, 

Enzyme Property Lab — Information, graphs 

Enzyme Study Using Simple Equipment — Lab. Information, links 

Enzymes I — Links, information, chart, graphs 

Enzymes II — Links, notes, graphs, illustrations 

Enzymes III — Descriptive information 

Enzymes: Allosteric — Links, notes, graph 

Enzymes: Factors Affecting (Temperature) — Information, graph 

Enzymes: Factors Affecting (Temperature & Pressure)
 — Extensive information, graphs, equations 

Enzymes: Significance: KM and Vmax I — Information, graphs

Enzymes: Significance: KM and Vmax II — Information, graphs, equations 

Enzyme Thermodynamics — Information, graph 

Enzyme Tutorials — Links to tutorials 

Enzymology — Extensive information

Feedback Inhibition — Information, diagrams 

Feedback: Negative — Information, links 

Hemoglobin Allostery I — Part I. Brief information, illustrations, graph

Hemoglobin Allostery II
 — Part II. Information, comparative conformations

Hemoglobin Allostery III
 — Brief information 

Hemoglobin Allostery Analysis — Heme ligand geometry information 

Induced Fit Hypotheses I — Brief description 

Induced Fit Hypothesis II — Information, diagram, links 

Induced Fit vs. Lock & Key Concept — Information, diagrams 

Invertase Activity in Root Growth — Lab. Information, links 

Lock and Key Hypothesis — Information, illustration 

Peroxidase — Information, diagram, links 

Peroxidase Links: Plants 

Polyphenol Oxidase (Browning Reaction) — Information (Potatos, mushes, etc.)

Pepsin — Information, illustration, links 

Pepsinogens and Pepsins — Information illustration

Reactions & Enzymes — Notes, graphs, illustrations, links I — Ribulose biphosphate carboxylase/oxygenase information 

Rubisco II — RuBP Information proj/Introduction.html 

Rubisco III — Information, illustrations, Calvin cycle info, illus, Calvin cycle 

Starch Digestion (Amylase), pH Effects I — Lab 

Starch Digestion (Amylase), pH Effects II — Lab

Starch Hydrolysis by Amylase — Lab

Zymogen I — Basic definition, information 

Zymogen II — Information, links 

Zymogen III — Defined 

[SIZE=+1]Nucleic Acids[/SIZE] 
Base Pairs — Illustrations 

Cytosine — Information, diagram, links 

DNA — Extensive information, illustrations,, links 

DNA Base Pairing — Diagrams, notes, table 

DNA: Introduction — Information, diagrams 

DNA vs. RNA — Information 

DNA Structure I — Information, illustration, tutorial 

DNA Structure II — Information, illustration, links 

DNA Synthesis — Links, extensive information 

mRNA — Information, diagram 

Nucleic Acids I — Links, information, diagrams Introduction & Internal links 

Nucleic Acids II — Information, diagram, links 

Nucleic Acids: Base Pairing — Information, illustration with hydrogen bonds

Nucleic Acid Structure and Function I 
— Information, illustrations 

Nucleic Acid Structure and Function II — Info, illustrations 

Nucleotide Biosynthesis — Information, illustrated reactions 

Nucleotide Metabolism — 15 hyperlinks 

Nucleotides — Described and illustrated 

Nucleotide Structure — Information, links, molecular diagrams 

Phosphodiester Bond — Information, diagram 

Purines and Pyrimidines I —Links, information 

Purines and Pyrimidines II — Information, illustration 

Purines and Pyrimidines III — Notes, illustrations 

Ribose and Deoxyribose Structure — Illustrations, brief note 

RNA — Information, links, diagram 

RNA Synthesis — Links, information, diagrams 

rRNA & Ribosome Synthesis — Information, diagrams 

snRNA — Defined 

[SIZE=+1]Energy Transformations[/SIZE] 
[SIZE=+1]Adenosine Triphosphate[/SIZE] 
Adenosine Triphosphate ATP — Notes, citroc acid pathway 

ATP and Biological Energy — Links, notes, extensive illustrations 

ATP and Other Nucleoside Triphosphates

ATP: Energy Currency of the Cell I — Extensive information, illustrations, diagrams 

ATP: Energy Currency of the Cell II — Information, animation 

ATP: Energy Currency of the Cell III — Information, properties, illustrations 

ATP Generation — Brief notes 

ATP Synthase I — Diagrams, graphs, tables information 

ATP Synthase II — Annotated links 

ATP Synthase III — Diagrams, illustrations, information 

ATP Synthase IV — Information, illustration 

ATP Synthase: Rotary Motor — Notes, diagram. illustration 

ATP Synthase Structure: Photosynthesis — Notes, diagram, information 

Chemiosmosis I — Information, illustrations 

Chemiosmosis II — Brief information, illustration 

Chemiosmosis III — Information, illustration 

Chemiosmotic Coupling — Information, links 

How ATP Transfers Energy — Extensive information, plus diagrams 

[SIZE=+1]Photosynthesis, Chemosynthesis[/SIZE] 
Chlorophyll — Information, illustrations, graph, chart 

Chlorophyll Absorption — Information, Illustration, graph with colors and wavelengths

Absorption Action Spectra — Information, illustration, graph 

C3 Carbon Fixation — Diagram, information 

C3, C4, CAM Metabolism — Information, pathway, illustration, graph 

C4 Carbon Fixation — Diagram, information 

C4 & CAM Pathways — Information 

C4 Metabolism — Information, diagrams

C4 Photosynthesis — Brief overview, diagram

Calvin Cycle (Dark Reaction) I — Information, pathway. Select dark reaction Cycle (Dark Reaction) II — Linked problem sets

Calvin Cycle (Dark Reaction) III — Information, diagrams, metabolic pathways

CAM Metabolism — Information, pathways

CAM Metabolism Lab

Carbohydrate Turnover — Information, reactions

Carbon Dioxide Fixation I — Notes. Basic Calvin cycle

Carotenoids — Questions/answers, illustrations, references

Chemiosmosis I — Information, diagrams II — Notes, diagram 

Chemiosmosis III — Information, equations 

Chemiosmotic Coupling — Extensive information 

Chemiosmosis and the Electron Transport System — Information, diagram. (Scroll down) 

Chemosynthesis I — Information

Chemosynthesis II — Information

Chemotrophic Bacteria — Information, links.(Beta Proteobacteria)

Chlorophyll and Accessory Pigments — Information, diagrams, graphs

Chlorophylls and Carotenoids — Information, molecular diagrams

Chlorophyll Fluorescence — Information, graphs

Chlorophyll Synthesis (Porphyrins) — Information, pathway, ilustrations

Chloroplast: Photosynthetic Membranes — Information, diagram (Scroll down)

Chloroplasts I — Notes, diagram, photomicrographs, links

Chloroplasts II — Diagrams, information 

Chloroplasts III — Information, illustrations 

Chloroplast Structure and Pigments — Information, photomicrographs

Chromatography I — Information, illustrations, charts, graphs

Chromatography II — Information, links 

Chromatography: Leaf Pigment — Information, spectra illustrations 

Chromatography: Leaf Pigment Lab I 

Chromatography: Leaf Pigment Lab II 

Chromatography: Thin Layer — Lab. Information, illustrations 

Coenzyme A — Illustrations, information 

Coenzymes I — Definition coenzyme

Coenzymes II — Information, links Acid Metabolism (CAM) I — Information

Crassulacean Acid Metabolism (CAM) II — Information, pathways, graph

Crassulacae Acid Metabolism: Cactus and Succulents — Pages of information 

Electron flow: Hill Reaction I — Lab notes, excellent diagrams, information 

Electron flow: Hill Reaction II — Diagrams, notes 

Electron Transport in Chloroplast — Information 

Flavonoides & Anthocyanins — Information — Information 

Glucogenesis — The synthesis of glucose. Notes, assorted facts 

Hill Reaction I — Diagrams, notes 

Hill Reaction II — Information, tables 

Hill Reaction III — Extensive information, illustrations

Hill Reaction Lab I 

Hill Reaction Lab II — Information, charts 

Light — Information, illustrations, graphs, pathways light absorbing molecules 

Light Absorption, Reflection and Transmission — Links, information,_Transmission_and_Reflection_of_Light_and_Heat 

Lighting, Artificial : Plants I — Information

Lighting, Artificial : Plants II — Information 

Light: Nature of — Notes, illustration, electromagnetic spectrum 

Light and Color Wavelengths I — Basic color theory 

Light and Color Wavelengths II 

Light Dependent Reactions — Information, animations 

Light Independent Reactions — Information 

Light and Optic Activities 

Light (Photon) Absorption — Discussion of color absorption 

Light Reactions I — GreatIllustrations (scroll down) 

Light Reactions II — Problem set. Links

Light Reactions III
 — Information, illustrations

Light Reactions IV 
— Brief overview, diagram 

Light Reactions V — Information, illustrations, graphs, pigments, pathways 

Light Reactions, Antennae, Photosystems — Notes

Light Reactions: Photolysis
 — Brief overview, diagram

Pentose Phosphate Pathway I 
— Links, notes, pathways,

Pentose Phosphate Pathway II
 — Brief information, pathway

Pentose Phosphate Pathway III 
— Inforrmation, pathways 

Porphyrin Biosynthesis — Pathway, information, molecular illustrations 

Photoinhibition: Dynamic — Information, illustrations, graph 

Photolytic Enzyme: Manganese Active Site — Information 

Photophosphorylation — Information, diagram 

Photophosphorylation: Cyclic I — Notes, diagrams 

Photophosphorylation: Cyclic II — Diagram, information 

Photophosphorylation: Noncyclic
 — Diagram, information

Photorespiration I
 — Notes, diagram, links

Photorespiration II 
— Graph, RuBP pathways 

Photorespiration III — Information 

Photorespiration IV — Information, illustrations, graphs, 

Photorespiration, C4 and CAM Metabolism — Information, illustrations

Photorespiration and C4 Plants — Links, notes, diagram

Photosynthesis I — Extensive information, illustrations, graphs, links 

Photosynthesis II — Extensive info 

Photosynthesis III — Links, notes, diagrams, graphs, etc. (same as above) 

Photosynthesis IV — Extensive notes, links illustrations 

Photosynthesis V — Animations, movies interactive Tutorial, links 

Photosynthesis Photosynthesis VI — Extensive notes, links illustrations 

Photosynthesis: Carbon Fixation — Brief notes, diagram 

Photosynthesis: Chlorophyll a, Reaction Center — Information, very extensive illustrations, diagrams, 101 Lectures/Photosynthesis/photosyn.htm

Photosynthesis: CO2 Levels— Extensive discussion

Photosynthesis: Factors Affecting — 28 short "clickable" pages of notes

Photosynthesis & Food Web Links — Annotated links

Photosynthesis Introduction I — Elementary introduction 

Photosynthesis Introduction II — Information, animation 

Photosynthesis Lab I — Elodea (Anacharis) Lab

Photosynthesis Lab II — Lab. Involves pH measurements by indicators

Photosynthesis Lab III — Lab. Light dependence measurement

Photosynthesis and Light Intensity I — Information 

Photosynthesis and Light Intensity II — Information, adaptations 

Photosynthesis Overview I — Includes historical development

Photosynthesis Overview II — Information, illustrations, diagrams, graph, etc.

Photosynthesis Problen Set 
— Information, links, questions

Photosynthesis Review — Extensive information, illustrations 

Photosynthesis: Summary Reaction — One of several slides in a series 

Photosynthesis: Tutorial, Animation & Plant Links — Links 

Photosynthetic Antennas & Reaction Centers — Information, illustrations 

Photosynthetic Membrane — Information, diagrams, illustrations, references

Photosynthetic Pigments I — Information

Photosynthetic Pigments II — Information, absorption spectra, pigment molecules

Photosynthetic Pigment Diversity — Lab. Information, tables, illustrations

Photosynthetic Process — Extensive information, links

Photosynthesis: Role of Light — Links, notes, electron pathways, diagram

Photosystems — Information 

Photosystems & ATP Synthesis — Information, diagram 

Plants: Artificial Light I — Information, illustrations

Plants: Artificial Light II — Questions/answers

Plant Lighting — Questions/answers

Plant Pigments — Illustrated notes, Information, references

Primary Productivity I — Information, illustration 

Primary Productivity II — Information, illustration, chart, reactions 

Primary Productivity III — Information, diagram, illustrations, links 

Primary Productivity: Net — Information, references

Proton, Electron Acceptors — Notes, graph, molecular diagrams

Proton Pump: Discussion

Rubisco I — RuBP. Carbon fixation discussion.

Rubisco II — RuBP carboxylase.

Rubisco III — Discussion proj/Introduction.html 

[SIZE=+1]Photosynthesis vs. Respiration[/SIZE] 
Diffusion: Gas Exchange in Organisms — Links, notes, charts, diagrams

Photosynthesis and Respiration: Energy Relationships
 — Notes, chart, pathways

Photosynthesis vs. Respiration 
— Information, summary reactions 

Photosynthesis and Respiration: Comparison I — Diagram, legend information

Respiration and Photosynthesis: Comparison II 
— Information 

Photosynthesis, Respiration and Transpiration 
— Links 

Acetyl Coenzyme A — Information, diagram, Kreb's cycle 

Acetyl Coenzyme A Formation I — Information, illustration 

Acetyl Coenzyme A Formation II — Information, reactions 

Acetyl CoA Metabolism — Illustration, overview 

Aerobic & Anaerobic Respiration — Interactive, animated exploration. Links 

Aerobic Respiration I — Overview 

Aerobic Respiration II — Information, illustrations, graphs, pathways 

Aerobic Respiration Summary — Information, notes 

Alcohol Metabolism — Information, metabolic pathways 

Amino Acid Metabolism I — Links, pathways, illustrations, information

Amino Acid Metabolism II
 — Information, links, diagram 

Anabolic & Catabolic Pathways — Information, illusltation 

Anaerobic Pathways — Links, information, glycolysis

Anaerobic Pathways, Fermentations
 — Links, notes, illustrations, diagrams 

ATP Synthesis on Mitochondrion — Animations, notes 

ß-oxidation of fatty acids — Information, pathways

Bioenergetics — History, orientation. Information

Biological Oxidations — Information, flow chart, illustrations, links,inhibitor table 

Catabolism of Lipids — Information, illustrations, reactions

Cellular Metabolism & Fermentation — Information, illustrations, links

Cellular Respiration I — Links, notes, diagrams, illustrations

Cell Respiration II — Links, animations, movies interactive tutorials 

Cellular Respiration Summary — Outlined Notes 

Chemiosmosis I — Information, diagrams

Chemiosmosis II — Notes, diagram 

Chemiosmosis III — Information 

Chemiosmotic Coupling — Electron transport, inner membrane metabolite transport 

Coenzymes — Defined, information 

Coenzymes and Vitamins — Information, tables, illustrations 

Dinitrolphenol — Chemical uncoupler. Information, diagram 

Electron Transport Chain & Chemiosmosis — Summary information, 5 animations 

Electron Transport, Oxidative Phosphorylation I — Path Ovierview, notes. table

Electron Transport, Oxidative Phosphorylation II
 — Links, pathway, chart, Illustrations

Electron Transport, Oxidative Phosphorylation III
 — Information, illustrations

Electron Transport System and Chemiosmosis
 — Information, illustrations (scroll down)

Fatty Acid Beta-Oxidation I 
— Links, information, diagrams

Fatty Acid Beta-Oxidation II
 — Notes, pathways, illustrations

Fatty Acid Oxidation 
— Information, pathways

Fatty Acid Oxidation and Keytone Bodies
 — Extensive links, pathways, information 

Fatty Acid Transport &Oxidation — Illustration, brief notes 

Fermentation and Anaerobic Respiration — Information, diagram

Flavin Adenine Dinucleotide (FAD)
 — Illistration, information

Glycolysis I
 — Links, notes, diagrams

Glycolysis II 
— Links, information, pathways, chart

Glycolysis III
 — Notes, illustration 

Glycolysis IV — Information 

Glycolysis: Individual Reactions — Notes, pathway 

Glycolysis and Citric Acid Cycle — Information, illustration 

Glycolysis: Non-glucose Carbons — Links, pathways, information

Glycolysis Reactions I
 — Information, links, illustration 

Glycolysis Reactions II — Information, illustrations 

Gluconeogenesis (Citric Acid Cycle) — links, information, pathways

Kreb's Citric Acid Cycle I
 — Information, pathways, table 

Kreb's Citric Acid Cycle II — With enzymes illustrated with a click

Kreb's Citric Acid Cycle III — Animated tutorial 

Kreb's Citric Acid Cycle Overview 

Krebs Citric Acid Cycle Summary 

Metabolic Poisons: How They Work — Basic information

Metabolic Poisons: Mitochondria — Information 

Mitochondrial Functions — Illustration, information, chart, links

Mitochondrial Pathways — Illustration, information, chart, links 

Nicotinamide Adenine Dinucleotide (NAD) I — Molecular diagram, information 

Nicotinamide Adenine Dinucleotide (NAD) II — Information, diagrams, links 

Oxidative Phosphorylation I — Information, illustrations 

Oxidative Phosphorylation II — Links, informatioin, diagrams 

Oxidative Phosphorylation III — Path Ovierview, notes. table 

Oxidative Phosphorylation IV — Information, diagram, links 

Oxidattive Phosphorylation V — Illustration, information, chart, links 

Oxidative Phosphorylation & Chemiosmosis — General information 

Oxidative Phosphorylation Mechanism — Extensive information 

Proton, Electron Acceptors — Graph, illustrations, notes

Proton-Motive Force: Proton Translocation — Outlined notes

Proton Pump and Mitochondrial Substructure/Function — Information, diagrams, photomicrographs Substructure

Pyruvate Dehydrogenate and the Kreb's Cycle — Information, molecular illustrations & pathways, table, key

Respiration Links 

Respiration: Aerobic — Summary study notes 

Respiration: Oxidation, Reduction — Links, pathway, chart, Illustrations

Respiration: Summary Equations — Summary Information

Respiration: Summary Reaction — Summary notes 

Tricarboxylic Acid (Kreb's) Cycle — Links, information, pathways 

Tricarboxylic Acid Cycle (TCA) — Defined, Information, links

Vitamins and Coenzymes — Information, molecular diagrams 

[SIZE=+1]Unit Photos, Illustrations[/SIZE] 
Absorption Spectra: All Pigments 

Alcohol Fermentation 

Antenna Complex: Photosynthesis 

Alpha Helix I 

Alpha Helix II 

Amino Acid I — Basic structure 

Amino Acid II 

Amino Acids III

Anabolic, Catabolic Pathways 

ADP - ADP Cycle 

ATP Synthase I 

Beta Pleated Sheet I 

Beta Pleated Sheet II 

C4 Photosynthetic Pathway 

C4 and CAM Pathways — Information, illustrations, graphs, pathways 

Calvin Carbon Fixation Cycle I 

Calvin Carbon Fixation Cycle II 

Calvin Carbon Fixation Cycle III 

Calvin Carbon Fixation Cycle IV 

Calvin Carbon Fixation Cycle V — Information, illustrations, graphs, pathways, photos 

Carbohydrate Molecules — Scroll down 

Carbohydrates: Sugars and Polysaccharides 

Cell Signal Transduction 

Cellulose Linkage 

Chemiosmosis Animation 

Chemiosmosis: ATP'ase 

Chemiosmosis I 

Chemiosmosis II 

Chemiosmosis III 

Chemiosmotic Phosphorylation 

Chemiosmosis, Proton Pump 


Chlorophyll Reaction Center 



Coenzyme Structure 

Dehydration Synthesis: Maltose, Succrose 


Deoxyribose and Ribose 

Disaccharides I 

Disaccharides II disaccharides.jpg 

Disaccharide Synthesis 

Dipeptide Synthesis 

Disulfide Bond I — Information, illustration 

Disulfide Bond II 

Disulfide Bond III 

Disulfine Bond IV 

Disulfide Bridge 

DNA Base Pairing and Helical Structure 

DNA Structure — Illustration, brief notes 

DNA vs. RNA I 


DNA vs, RNA Nucleotides 

Electron Transport, Chemiosmosis, ATP Synthetase I

Electron Transport, Chemiosmosis, ATP Synthetase II 

Electron Transport, Chemiosmosis, ATP Synthetase III 

Electron Transport: Mitochondrion: Animation 

Electron Transport System: Energy Release 

Enzyme: Allosteric 

Enzyme: Induced Fit Concept — Animated diagram Web Pages/Chem 4310/Lectures/proper3.jpg 

Fat: Saturated 

Fat: Saturated & Unsaturated 

Fatty Acid & Glycerol Catabolism 

Fatty Acids acid.jpg 

Fatty Acid: Saturated I 

Fatty Acid: Saturated II 

Fatty Acids: Beta Oxidations 

Fatty Acids: Saturated and Unsaturated acid.jpg 

Fatty Acid: Unsaturated 

Fat: Unsaturated 

Fructose I 

Fructose II 



Glyoxylate Shunt I

Glyoxylate Shunt II 

Glyceraldehyde-3-Phosphate: Products 

Glycerol, Fatty Acid 

Hemoglobin Molecule I 

Hemoglobin Molecule II 

Hill Reaction 

Induced Fit Animation 

Krebs Citruc Acid Cycle I 

Krebs Citruc Acid Cycle II 

Krebs Citruc Acid Cycle: Highlighted Summary 

Light Reactions I — Information, illustrations 

Light Reactions II — Extensive information, illustrations

Light Reactions: Cyclic 

Light Reactions: Noncyclic 

Light Reaction: Photolysis Diagram 

Lipids Illustrated — 3 types 

Maltose Synthesis 


Nucleotides: DNA 

Nucleotides: DNA & RNA 

Nucleotides: RNA 

Nucleotides: tRNA 

Nucleotide Structure I 

Nucleotide Structure II 

Nucleotide Structure III

Oxidative Phosphorylation I 

Oxidative Phosphorylation II 

Oxidative Phosphorylation: Chemiosmotic Coupling 

Peptide Bonds I 7.07.jpg 

Peptide Bonds II 

Phosphodiester Bond 

Phospholipid I 

Phospholipid II 

Phospholipid III 


Photophosphorylation: Noncyclic 


Photosynthesis Action Spectrum 

Photosynthesis: Summary Equation$FILE/cc_img_carbonoxygen.gif 

Photosynthesis: Summary Reaction 

Photosystem I — Illustration 

Photosystem II 

Photosystems web pages2/photosystems 2 and 1.htm 

Polypeptide: Synthesis — Overview 

Polypeptide Synthesis Overview 

Polysaccharides I 

Polysaccharides II V 

Polysaccharides III 

Polysaccharides IV 

Protein Quartenary Structure 

Protein Structures I 

Protein Structures II 

Protein Synthesis: Transcription, Translation Animation 

Protein Synthesis: Transcription, Translation Animation

Proton Accumulation: Mitochondrial Intermembrane Space 

Protein Tertiary Structure 

Photon Excitation of Atoms 

Proton Accumulation: Mitochondrial Intermembrane Space 

Proton Pump 

Proton Pump: Chemiosmosis 

Purines and Pyrimidines 2/bases.jpg 

Respiration: Summary Reaction 


Ribose & Deoxyribose 

Sodium-Potassium ATPase Pump 


Tricarboxylic Acid (Kreb's) Cycle I 

Tricarboxylic Acid (Kreb's) Cycle II

------------------------------------------ Best Wishes: Dr.Ehab Aboueladab, Tel:01007834123, ------------------------------------------
Post a Comment